凤梨为典型的自交不亲和作物，天然状态下高度依赖异花授粉；而其原生境主要传粉者蜂鸟在我国并无自然分布，杂交育种因此必须完全依靠人工授粉完成。从种下亲本到品种审定，一个凤梨新品种通常需要约 8 年：第一年秋季定植杂交亲本组合，第三年春季人工授粉、取种育苗，第四年杂种实生苗下地，第六年首批果实挂果后启动初选优株，直至第八年株系性状稳定、整齐一致，方可决选定名。
凤梨开花多集中在上午 8:00—12:00，而柱头最适授粉状态仅维持约 2 小时 —— 此时花瓣充分张开、柱头微微外露并分泌黏液。科研人员需用毛笔蘸取父本花粉，轻柔涂抹于母本柱头。单个果序着生小花数十至上百朵，须逐朵授粉、重复 20~30 次，并连续数日作业才能完成一个杂交组合。授粉后待杂交果实充分成熟采收，切去冠芽与果蒂，果肉切块、漂淘取得细小种子，再经催芽、育苗进入下一代选择。
这是一项 "针尖上的绣花"：窗口期一旦错过，全年杂交计划便顺延一年。本所长期坚持大规模杂交种质创制与逐代系统筛选，从数万份杂交后代群体中连续鉴定、选择优株，进而形成一批遗传稳定的优良株系，持续为产业提供具有自主知识产权的凤梨新种质。育种是一场与时间的长跑，耐心、积累与精准的田间选择，缺一不可。
